• President:

    Yuka Imamura Kawasawa

    川沢（今村）百可

    アメリカ、ペンステート医学部でゲノミクス・バイオインフォマティクスやってました。思うところあり退職し、非常勤准教授に。本業を民間企業の解析屋に変えました。フルリモートにて自宅から勤務。動物ゲノムと日本人会を空き時間に兼業。

     

    WGS, exome, methylation, ChIP-seq, metagenome, RNA-seq, qPCR, dPCR, マイクロアレイ、一細胞ゲノミクス、エクソソーム、バイオマーカー、NGSの解析教育、動物ゲノムなど。。。

  • President:

    Yuka Imamura Kawasawa

    川沢（今村）百可

    アメリカ、ペンステート医学部でゲノミクス・バイオインフォマティクスやってました。思うところあり退職し、非常勤准教授に。本業を民間企業の解析屋に変えました。フルリモートにて自宅から勤務。動物ゲノムと日本人会を空き時間に兼業。

     

    ペンステ残り業務はこちらから。

    http://sites.psu.edu/yuka/

    https://twitter.com/gsfpsucom

     

    動物ゲノム研究所

    http://animalgenomeinstitute.org

    https://twitter.com/animalgenomein1

    https://www.facebook.com/animalgenomeinstitute

    WGS, exome, methylation, ChIP-seq, metagenome, RNA-seq, qPCR, dPCR, マイクロアレイ、一細胞ゲノミクス、エクソソーム、バイオマーカー、NGSの解析教育、動物ゲノムなど。。。

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  • EXPERIENCE

    私の過去の研究遍歴

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    Eurofins Transplant Genomics Inc

     

    Bioinformatics Scientist

    2022 -

     

    民間企業で働きたいと常々思っていたのですが、コロナその他で機が熟し、５０前にして転職しました！

     

    フルリモートの解析屋です。研究したことが商品になり患者さんを救う、という点にやりがいを感じてます。

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    Penn State University College of Medicine

    Director, Penn State Hershey Genome Sciences and Bioinformatics Facility

    Associate Professor of Pharmacology, Biochemistry and Molecular Biology

    2013 - 2022

     

    憧れのコアのディレクター職に！

    NGSサンプルプレップから解析まで全部やってました。

     

    苦手なのは請求書の計算と政治。。。（汗）

    Yale University

    Associate Research Scientist

    2009 - 2013

     

    PostDoc

    2005-2008

     

    Program manager for BrainSpan Consortium Project (http://www.brainspan.org/). Studying transcriptional mechanisms involved in human brain development and evolution.

     

    ヒト脳のマイクロアレイ、NGSやってました。ボスは最近ブタ脳を蘇生させて話題になった人。。。

    The Rothberg Institute for Childhood Diseases

    Research Associate

    2008-2009

     

    NGS analysis on childhood disease

     

    NGSの基礎、R&Dラブのメンタリティはここで鍛えて頂きました。

    Howard Hughes Medical Institute, University of Texas Southwestern Medical Center at Dallas - JST ERATO Yanagisawa Orphan Receptor Project

    Postdoctoral Associate

    2001 - 2005

     

    Screening and characterization of natural ligands for orphan G protein-coupled receptors

     

    ダラス＆お台場の柳沢正史研でオーファンGPCRのリガンドハンティングしてました。

  • SKILLS

    NGSに関するものなら何でも

    Molecular Biology

    NGSに関わるR&Dなら何でも

    一細胞、FFPEなど、難しいサンプルも承ってます。

    Sequencing

    イルミナを主に使ってます。時々ONT (Oxford Nanopore Technologies）、Ion Torrent、PacBio、新しくBioNanoも導入してます（sequencingというよりはmappingですが）。

    Genomics

    ヒト疾患サンプルが主な対象ですが、基礎研究ものも扱ってます。最近は植物やバクテリアのお客さんも。

    Bioinformatics

    DNA, RNA, epigenome (ChIP-seq, open chromatin, methylation), metagenome, network analysisなどもやってます。下流の解析はR, pythonを使ってます。

    Education

    小２０１８年からペンステートワールドキャンパス（通信教育）でバイオインフォマティクス１を教えました。医学部では単発講義がメインでしたが、学生以外も対象にNGS解析講習を開きました。

    Entrepreneurship

    念願の猫ウンチプロジェクト、遂に始動！獣医さん兼修士課程の学生さんの学位プロジェクトとしてネズミモデルで始めてます。

     

    Nonprofitの研究所を立ち上げました。動物ゲノム、バイオインフォの普及が主な活動内容です。

  • EDUCATION

    東大に１０年いました

     

     

    The University of Tokyo

    Ph.D. Biochemistry and Molecular Biology 1997 – 2001

     

    医学部｜清水孝雄研で生理活性脂質；GPCRの研究してました。

     

     

    The University of Tokyo

    B.S., M.Sc. Applied Biochemistry 1991 – 1997

     

    農学部｜ノーバケ野口忠研で糖尿病；IGFの研究してました。

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    動物ゲノム研究所を通しての研究解析依頼受付中！NGSを勉強したい方、将来コアで働きたい方の人生相談にも乗ります。どしどしご連絡下さい！

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